Руководитель учреждения — Министерство природных ресурсов и экологии Калининградской области

- контроль и координация деятельности, организация работы учреждения;

- обобщает практику применения на территории Калининградской области нормативных правовых актов, регламентирующих деятельность
в области водных отношений;

- участие в осуществлении предоставления прав владения, пользования, распоряжения водными объектами, находящимися в собственности Калининградской области;

- участие в установлении ставок платы за пользование водными объектами, находящимися в собственности Калининградской области;

- участие в разработке и реализации федеральных государственных,
в том числе бассейновых, программ по использованию, восстановлению
и охране водных объектов, а также федеральных государственных программ
по предупреждению последствий вредного воздействия вод;

- участие в разработке и реализации региональных программ
по использованию и охране водных объектов или их частей, расположенных
на территории Калининградской области;

- участие в подготовке, заключении и реализации бассейновых соглашений об использовании, восстановлении и охране водных объектов
на территории Калининградской области;

- участие в разработке и согласовании схем комплексного использования и охраны водных ресурсов на территории Калининградской области;

- участие в подготовке и осуществлении противопаводковых мероприятий на территории Калининградской области;

- участие в организации проведения предпаводкового
и послепаводкового обследования паводкоопасных территорий и водных объектов;

- участие в организации и осуществлении государственного мониторинга водных объектов;

- участие в осуществлении мер по предотвращению негативного воздействия вод и ликвидации его последствий в отношении водных объектов, находящихся в собственности Калининградской области, в федеральной собственности и расположенных на территории Калининградской области;

- участие в осуществлении мер по охране водных объектов или
их частей, находящихся в собственности Калининградской области, федеральной собственности и полностью расположенных на территории Калининградской области;

- участие в осуществлении мер по охране водных объектов, находящихся в собственности Калининградской области;

- участие в организации проведения мероприятий по увеличению пропускной способности русел рек, их расчистке, дноуглублению;

- участие в предоставлении водных объектов или их частей, находящиеся в собственности Калининградской области, в пользование на основании договоров водопользования, решений о предоставлении водных объектов
в пользование;

- участие в подготовке документов о предоставлении водных объектов или их частей, находящиеся в собственности Калининградской области,
в федеральной собственности и расположенных на территории Калининградской области, в пользование на основании договоров водопользования, решений о предоставлении водных объектов в пользование, за исключением случаев, указанных в части 1 статьи 21 Водного кодекса Российской Федерации;

- формирование аналитических материалов, в отношении водных объектов, находящимися в собственности субъектов Российской Федерации.

Обязательно наличие высшего образования и не менее четырех лет стажа гражданской службы или стажа работы по специальности, направлению подготовки;