Старший биоинформатик — ФГБУ ЦСП ФМБА России

Отдел биоинформатики и системного анализа ищет опытных специалистов для работы с данными секвенирования человека. За последние годы опубликованы результаты по нескольким масштабным проектам, в которых мы приняли непосредственное участие:

1. База данных популяционных частот генетических вариантов населения Российской Федерации. Для создания Базы использовали данные полногеномного секвенирования 120 тысяч человек со всей России.
2. Российский референсный геном человека
3. Российский эталонный образец

Мы активно развиваем эти проекты и запускаем ряд новых исследований в медицинской сфере. Для реализации всех планов мы расширяем команду биоинформатиков и рассматриваем резюме опытных специалистов.

Обязанности:

• Поддержание и развитие существующих пайплайнов по анализу данных секвенирования (WGS, RNASeq).
• Сборка и оптимизация новых пайплайнов, подбор наиболее подходящих программ обработки данных секвенирования в зависимости от поставленных целей.
• Участие в создании, поддержке и развитии внутренних баз данных.
• Формирование и проверка научных гипотез, биологическая интерпретация результатов
• Планирование и контроль проведения экспериментов (биоинформатических и в лаборатории).
• Написание научных публикаций, представление на конференциях результатов исследований.

Требования:

Основные:

1. Понимание принципов работы технологий секвенирования (Illumina, Nanopore, PacBio и др.).
2. Знание как минимум одного языка программирования на продвинутом уровне.
3. Опыт работы в командной строке (bash), владение Git.
4. Знание английского языка на уровне чтения технической документации и научных статей.
5. Навыки самостоятельной работы; готовность брать на себя ответственность за результат.
6. Готовность заниматься подготовкой научных статей, докладов.
7. Внимательность, аккуратность.

Организационные:

1. Наличие диплома о высшем образовании. В приоритете техническое, математическое, биоинформатическое, медико-биологическое образование.
2. Минимум 5 лет опыта
3. Российское гражданство, отсутствие двойного гражданства, видов на жительство.
4. Очное присутствие в офисе в Москве обязательно.

Будет плюсом:

1. Умение работать с вычислительными кластерами
2. Наличие открытых репозиториев на Github.
3. Инициативность.

Зарплата:

150-200 тыс. руб. в зависимости от навыков, опыта работы и скорости обучения. Выход за рамки вилки возможен и оговаривается отдельно.

Условия:

• График работы: 9:30-18:00 (включая 30 минут на обед). При необходимости есть возможность сдвинуть время начала рабочего дня.
• Работа исключительно очно (метро Щукинская, МЦД Стрешнево), удаленного формата нет.
• Индивидуальное рабочее место с мощным ноутбуком и двумя мониторами.
• Возможно прикрепление к ведомственной поликлинике.
• Парковка есть, оговаривается индивидуально.

Что мы можем предложить:

1. Разнообразные задачи в зависимости от имеющихся навыков и желаемой траектории развития.
2. Очень много данных и мощная инфраструктура для их анализа.
3. Прозрачные рабочие процессы: отслеживаем задачи в Gitlab.
4. Светлый, просторный офис рядом с парком, в 10-15 минутах ходьбы от станции метро Щукинская и МЦД Стрешнево.
5. Индивидуальное рабочее место с мощным ноутбуком и двумя мониторами.
6. Посещение семинаров, школ, конференций и других мероприятий за счет работодателя.

Стек технологий:

• Язык разработки: Python, bash
• Работа с пайплайнами: Docker, CWL
• Совместная работа над кодом: GitLab